En Allende las especies más comunes de flora son: chaparro, prieto, cenizo, mezquite, polvo verde, chaparro amargoso, oreganillo, huizache, encino, nogales, lechuguilla y los nopales. Y en la fauna se encuentran especies de conejos, liebres, ardillas, tlacuaches, coyotes, palomas, hurracos, águilas , codornices y salta montes.