La ciudad de Allende está localizada a 28°20′30″N 100°50′2″O, a una altitud de 374 msnm. Se asienta sobre la carretera federal número 57, con Saltillo, la capital del estado, a aproximadamente 390 km hacia el sur, mientras la frontera internacional en Piedras Negras, Coahuila (cruzando el Río Bravo está Eagle Pass, Texas, EE. UU.) está a unos 55 km hacia el norte. Allende es atravesado por las vías del ferrocarril que conecta Saltillo con la ciudad fronteriza de Piedras Negras, Coahuila (cruzando el río desde Eagle Pass, Texas, Estados Unidos). Esta ciudad está localizada en la región de "los 5 Manantiales" (Allende, Morelos, Nava, Villa Unión y Zaragoza), llamada así pues cada ciudad cuenta con un nacimiento de agua. En esta zona predominan los nogales, por lo que son productores de nuez.